Az Alapítvány önálló jogi személy, a kitűzött cél megvalósulásáról, a hat tagú kuratórium elvi irányításával egy menedzser, egy titkár és egy könyvelő gondoskodik.

 A Kuratórium általában nyilvános üléseit igény szerint tartja, döntéseit szavazattöbbséggel hozza. A kuratórium elnökét és tagjait a NOVOFER Zrt. vezérigazgatója bízza meg, 1998-tól kezdődően négy éves időtartamra.  Az első kuratórium a megalakulástól kezdődően, 1993 végéig irányította a munkát.

A NOVOFER Alapítvány újjáválasztott kuratóriuma és Felügyelő Bizottsága a

2011. január 1 - 2015. január 31 közötti időszakra:

Dr. Gyulai József akadémikus

A Kuratórium tagjai:

Dr. Drozdy Győző villamosmérnök, a TELENOR Magyarország vezérigazgató-helyettese,

Dr. Ginsztler János akadémikus, egyetemi tanár, a Magyar Mérnökakadémia elnöke,

Karsai Béla, a Karsai Holding elnöke,

Dr. Pap László akadémikus, egyetemi tanár,

Szepesváryné dr Tóth Klára egyetemi tanár.

A titkári teendőket Kosztolányi Tamás gépész és gazdasági mérnök, szabadalmi ügyvivő látja el.

Az Alapítvány gazdálkodását 3 tagú Felügyelő Bizottság ellenőrzi, melynek elnöke

Dr. Gruber Attila ügyvéd,

és tagjai

Dr. Imre József kandidátus, egyetemi magántanár,

Dr. Inzelt Péter kandidátus, az MTA SZTAKI igazgatója.

Az Alapítvány szervezetéhez tartozik a nemzetközi Gábor Dénes-díj odaítélésére javaslatot tevő díjbizottság. E nemzetközi testület három évenként egy magyar és egy külföldi, 35 év alatti fiatal tudóst tüntet ki nemzetközi Gábor Dénes-díjjal, a névadó munkássága szellemében inspirált területeken (alkalmazott fizika, műszaki alapkutatások, informatikát megalapozó eredmények), vagy az ott elért kutatási eredményeket hasznosító tudományos szakterületeken (pl. az orvostudomány területén) elért kimagasló eredményeikért.

A 2008-ban újjászervezett nemzetközi díjbizottság tagjai:

  Kroó Norbert akadémikus, a Magyar Tudományos Akadémia alelnöke, a díjbizottság elnöke;

  Czitrovszky Aladár kutató, az MTA SzFKI dolgozója,

  Horváth Zalán akadémikus, az Eötvös Lóránd Tudományegyetem egyetemi tanára,

  Krausz Ferenc professzor, a Ludwig-Maximilians-Universitat Munich egyetemi tanára,

  Lippényi Tivadar, a Nemzeti Kutatási és Technológiai Hivatal elnökhelyettese,

  Richter Péter professzor, a Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem tanszékvezető egyetemi tanára,

  Sánta Imre a Pécsi Tudományegyetem docense,  a DDKKK igazgatója,

  Szatmári Sándor professzor, a Szegedi Tudományegyetem tanszékvezető egyetemi tanára,  

  Martial Ducloy professzor, (Laboratoire de Physique des Lasers Institut Galilee, Univbersite Paris-Nord),

  Richard A. Syms professzor, (Imperial College London, Dept. of Electrical and Electronic Eng. UK)

  Boris I. Denker professzor, (Prokhorov General Physics Institute, Russia Academy of Sciences, Moscow),

  Yeung Yam professzor, (The Chinese University of Hong Kong),

  Hideki Hashimoto professzor, (University of Tokyo, Japán)

A díjbizottság titkári teendőit dr. Baranyi Péter, nemzetközi Gábor Dénes-díjas kutató látja el.